崔杰课题组揭示海洋无脊椎动物RNA病毒的遗传多样性

　　5月6日，国际重要学术期刊《中国科学：生命科学》（SCIENCE CHINA Life Sciences）在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所崔杰研究组题为“Virome in Marine Ecosystems Reveal Remarkable Invertebrate RNA virus Diversity”的最新研究成果。 

　　海洋蕴藏着丰富的资源，具有极大的开发潜力；但海洋生物安全问题同样需要引起更高的重视。海洋中不仅有着许多尚未被发现的动、植物物种，还有着数量更为庞大、种类繁多的微生物。传统的海洋病毒研究多集中在噬菌体为代表的DNA病毒上，对多样性高、基因组不稳定的RNA病毒的遗传多样性、分布特征以及传播模式等均不清楚。 

　　无脊椎动物转录组中病毒的病毒分布和多样性：上方的柱状图展示了每个文库中的PE reads数目，不同颜色代表着不同的样品采集地点：东海——红色，黄海——黄色，南海——蓝色，每个文库的名称和宿主的分类在柱状图的顶部展示。下方的柱状图展示了每个文库中发现的病毒种类和数量。 

　　崔杰团队从不同海域共采集了3门6纲58种的海洋无脊椎动物样品，并利用宏转录组的测序方法对不同物种的RNA病毒组进行研究。该团队使用改进的生物信息分析方法，鉴定出了涵盖9个病毒家族（Durnavirales、Totiviridae、Bunyavirales、Chuviridae、Picornavirales、Flaviviridae、Hepelivirales、Solemoviridae、Tombusviridae）的363个RNA病毒，其中的315个与已知的RNA病毒相似度较低，被认为是全新的RNA病毒。该团队报道了3个海洋无脊椎动物汉坦样病毒，其较陆地汉坦病毒更为古老，进一步支持了汉坦病毒具有海洋起源的可能。结合基因组结构和统计学分析，该团队展示了丰富的海洋病毒遗传多样性和病毒基因组可塑性，揭示了不同海域间、不同宿主类别间可能存在的病毒传播现象。整体而言，该研究通过解析海洋无脊椎动物RNA病毒组，描绘病毒生态圈，为海洋RNA病毒的起源、进化、传播提供了重要见解。 

　　病毒跨宿主传播速率与病毒数目的相关性：横坐标反映了病毒的数量，纵坐标反映了病毒跨宿主传播事件的频率，连线和灰色区域代表了线性回归分析的拟合曲线以及95%的置信区间。 

　　硕士研究生张誉译和科研助理陈毅聪为本文的共同第一作者，崔杰研究员为本文的通讯作者。该研究得到国家自然科学基金、中国科学院分子病毒与免疫重点实验室等项目的资助。 

　　文章链接：http://engine.scichina.com/doi/10.1007/s11427-020-1936-2